一株猪流行性腹泻病毒变异株的分离、鉴定与全基因组序列分析

doi:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2024.07.022

湖北农业科学 ›› 2024, Vol. 63 ›› Issue (7): 134-140.doi: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2024.07.022

一株猪流行性腹泻病毒变异株的分离、鉴定与全基因组序列分析

刘曦¹, 贾相超¹, 李晨曦¹, 李自力^1,2,3

1.华中农业大学动物医学院,武汉 430070;
2.湖北省预防兽医学重点实验室,武汉 430070;
3.农业微生物学国家重点实验室,武汉 430070

收稿日期:2023-06-12 出版日期:2024-07-25 发布日期:2024-07-24
通讯作者: 李自力,（电子信箱）lizili@mail.hzau.edu.cn。
作者简介:刘曦（1999-）,女,四川绵阳人,在读本科生,专业方向为动物医学,（电话）15281199862（电子信箱）liuxi9862@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金项目（32072845）

Isolation, identification and whole genome sequence analysis of a porcine epidemic diarrhea virus variant strain

LIU Xi¹, JIA Xiang-chao¹, LI Chen-xi¹, LI Zi-li^1,2,3

1. College of Veterinary Medicine, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China;
2. Key Laboratory of Preventive Veterinary Medicine in Hubei Province, Wuhan 430070, China;
3. State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, Wuhan 430070, China

Received:2023-06-12 Published:2024-07-25 Online:2024-07-24

摘要/Abstract

摘要： 江苏省某猪场疑似发生猪流行性腹泻（Porcine epidemic diarrhea,PED）,采集病料后,经RT-PCR检测PEDV呈阳性。病毒感染Vero细胞能够引起明显的细胞病变,间接免疫荧光鉴定结果显示病毒感染细胞后能被抗PEDV N蛋白的特异性单克隆抗体识别。通过全基因组序列分析,鉴定该毒株为PEDV G2b亚型变异株,并将其命名为PEDV JS-B株。

关键词: 猪流行性腹泻病毒, 分离鉴定, 变异毒株, 分段测序, 序列分析

Abstract: PED was suspected to have occurred in a pig farm in Jiangsu Province, and after collection of disease material, PEDV was tested positive by RT-PCR. Virus-infected Vero cells were able to cause significant cytopathic changes, and the immunofluorescence results showed that the virus-infected cells could be recognized by a specific monoclonal antibody against PEDV N protein. Through whole genome sequence analysis, this strain was identified as a PEDV G2b subtype variant and designated PEDV JS-B strain.

Key words: porcine epidemic diarrhea virus, isolation and identification, variant strain, segmental sequencing, sequence analysis

中图分类号:

S852.65

刘曦, 贾相超, 李晨曦, 李自力. 一株猪流行性腹泻病毒变异株的分离、鉴定与全基因组序列分析[J]. 湖北农业科学, 2024, 63(7): 134-140.

LIU Xi, JIA Xiang-chao, LI Chen-xi, LI Zi-li. Isolation, identification and whole genome sequence analysis of a porcine epidemic diarrhea virus variant strain[J]. HUBEI AGRICULTURAL SCIENCES, 2024, 63(7): 134-140.

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Isolation, identification and whole genome sequence analysis of a porcine epidemic diarrhea virus variant strain

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