一株新城疫病毒F基因的克隆及其遗传进化分析

doi:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.15.031

湖北农业科学 ›› 2019, Vol. 58 ›› Issue (15): 132-135.doi: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.15.031

一株新城疫病毒F基因的克隆及其遗传进化分析

徐萍^{1, 2}, 徐小博¹, TATIANAFotina², 王三虎³, 赵坤³

1.新乡学院生命科学技术学院, 河南新乡 453003;
2.乌克兰苏梅国立农业大学兽医学院, 乌克兰苏梅 40021;
3.河南科技学院动物科学学院, 河南新乡 453003

收稿日期:2018-07-16 发布日期:2019-11-13
通讯作者: 赵坤（1968-）, 男, 河南南阳人, 教授, 博士, 主要从事传染病学教学与研究工作, （电子信箱）zhaokun@hist.edu.cn。
作者简介:徐萍（1986-）, 男, 河南郑州人, 助教, 硕士, 主要从事动物传染病学研究, （电话）18236196531（电子信箱）afraxp1986@126.com;
基金资助:
河南省基础与前沿技术项目（142300410017; 132300410014）

Cloning and genetic evolution analysis of one strain of newcastle disease virus

XU Ping^{1, 2}, XU Xiao-bo¹, TATIANA Fotina², WANG San-hu³, ZHAO Kun³

1.College of Life Science and Technology, Xinxiang University, Xinxiang 453003, Henan, China;
2.Department of Veterinary Medicine, Sumy National Agrarian University, Sumy 40021, Ukraine;
3.College of Animal Science and Technology, Henan Institute Science and Technology, Xinxiang 453003, Henan, China

Received:2018-07-16 Published:2019-11-13

摘要/Abstract

摘要： 从新乡市某养鸡场的疑似新城疫病鸡群中分离到1株新城疫病毒, 并对该病毒分离株进行F基因的扩增、序列测定和遗传进化分析。结果表明, 该新城疫病毒分离株的F基因全长为1 662 bp, F蛋白裂解位点区的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117, 具备强毒株的特征;同源性分析表明, 该新城疫病毒分离株与国内外流行的基因Ⅶ型强毒株之间的同源性较高, 为87.5%~97.7%, 其中与国内流行的基因Ⅶd型的参考毒株同源性最高, 为95.4%~97.7%, 而与现用疫苗株La Sota、Clone-30、B1、Mukteswar等同源性较低, 84.2%~86.6%;系统进化树分析表明, 该新城疫病毒分离株与基因Ⅶd型参考毒株FJ882014、FJ608335和GU227738处在同一个进化分支上, 亲缘关系最近。

关键词: 新城疫病毒, F基因, 克隆, 序列分析, 遗传进化, 鸡

Abstract: A Newcastle disease virus（NDV） was isolated from ND suspected chickens of a scale chicken farm in Xinxiang. The F gene of the isolated Newcastle disease virus（NDV） was amplified and analyzed by genetic evolution. The results showed that the whole nucleotied sequence length of F gene was 1 662 bp. The sequence of amino acid of F gene at the cleavage site is 112R-R-Q-K-R-F117, which is consistent with the characteristics of strong NDV strain. Comparison of the NDV with the strong NDV of gene Ⅶ of epidemic strains from different countries, results showed that the nucleotide homology was 87.5%~97.7%, and in which the comparison with the Ⅶd was 95.4%~97.7%. Comparison of the NDV isolated with the current vaccine strains such as La Sota, Clone-30, B1, Mukteswar and so on, the nucleotide homology was 84.2%~86.6%. The phylogenetic tree analysis demonstrated that the NDV isolated and Ⅶd strains of FJ882014, FJ608335 and GU227738 were located in the same cladogram branch.

Key words: Newcastle disease virus, F gene, cloning, sequence analysis, genetic evolution, chicken

中图分类号:

徐萍, 徐小博, TATIANAFotina, 王三虎, 赵坤. 一株新城疫病毒F基因的克隆及其遗传进化分析[J]. 湖北农业科学, 2019, 58(15): 132-135.

XU Ping, XU Xiao-bo, TATIANA Fotina, WANG San-hu, ZHAO Kun. Cloning and genetic evolution analysis of one strain of newcastle disease virus[J]. HUBEI AGRICULTURAL SCIENCES, 2019, 58(15): 132-135.

参考文献

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Cloning and genetic evolution analysis of one strain of newcastle disease virus

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