15种药用植物的GGPPS蛋白生物信息学分析

doi:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.02.029

湖北农业科学 ›› 2019, Vol. 58 ›› Issue (2): 131-136.doi: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.02.029

15种药用植物的GGPPS蛋白生物信息学分析

郝爱平, 国会艳, 齐虹凌, 魏继承

牡丹江师范学院生命科学与技术学院,黑龙江牡丹江 157011

收稿日期:2018-06-29 出版日期:2019-01-25 发布日期:2019-11-26
作者简介:郝爱平（1979-）,女,山东莘县人,副教授,硕士,主要从事生物信息学研究,（电话）18645353759（电子信箱）swxhap@126.com。
基金资助:
牡丹江师范学院一般项目（科技）（YB2017001）; 牡丹江市科学技术计划项目（G2015d1974）

Bioinformatic Analysis of GGPPS Protein in 15 Medicinal Plants

HAO Ai-ping, GUO Hui-yan, QI Hong-ling, WEI Ji-cheng

College of Life Sciences and Technology,Mudanjiang Normal College,Mudanjiang 157011,Heilongjiang,China

Received:2018-06-29 Online:2019-01-25 Published:2019-11-26

摘要/Abstract

摘要： 利用生物信息学的方法对15种药用植物GGPPS蛋白的理化性质、亚细胞定位、功能结构域、二级结构以及三级结构等方面进行预测和分析。结果表明,药用植物GGPPS蛋白是一种亲水性、不稳定的非跨膜蛋白,都具有一个相同的功能结构域polyprenyl-synt。GGPPS蛋白二级结构与三级结构的主要结构元件是α-螺旋和无规则卷曲。同源性分析表明GGPPS蛋白具有很高的保守性,雷公藤（Tripterygium wilfordii）GGPPS蛋白与其余14种植物的亲缘关系较远。

关键词: 药用植物, GGPPS, 生物信息学

Abstract: ： The biological information method of GGPPS protein in 15 kinds of medicinal plants physicochemical properties,subcellularlocalization,domainsites,subcellularlocalization,secondary structure and tertiary structure were analyzed. The results showed that medicinal plants GGPPS protein was hydrophobicity and unstable trans membrane protein,which had the same function structure domainsites polyprenyl-synt. The main components of the secondary and tertiary structure were alpha helix and random coil. Homology analysis showed that GGPPS proteins with highly conserved amino acid sequence,the homology Tripterygium wilfordii GGPPS protein and other 14 kinds medicinal plants were lower.

Key words: medicinal plants, GGPPS, bioinformatics

中图分类号:

R284.3

郝爱平, 国会艳, 齐虹凌, 魏继承. 15种药用植物的GGPPS蛋白生物信息学分析[J]. 湖北农业科学, 2019, 58(2): 131-136.

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Bioinformatic Analysis of GGPPS Protein in 15 Medicinal Plants

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